Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc97Q9DBT3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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