Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smg9Q9DB90 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms