Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms