Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Utp23Q9CX11 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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