Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm16499-201ENSMUST00000204648 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm11686-201ENSMUST00000122397 333 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PtprtQ99M80 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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PtprtQ99M80 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Elof1-201ENSMUST00000013966 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm12904-201ENSMUST00000117451 1399 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms