Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms