Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lims1Q99JW4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Lims1Q99JW4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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