Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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