Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Srsf4Q8VE97 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms