Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssh3Q8K330 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssh3Q8K330 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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