Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fcho1Q8K285 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcho1Q8K285 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcho1Q8K285 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcho1Q8K285 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcho1Q8K285 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcho1Q8K285 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Fcho1Q8K285 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fcho1Q8K285 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms