Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Abcf3Q8K268 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Abcf3Q8K268 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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