Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctdsp2Q8BX07 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctdsp2Q8BX07 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms