Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp54Q8BL06 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms