Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc88cQ6VGS5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ccdc88cQ6VGS5 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
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Ccdc88cQ6VGS5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms