Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
GcsamQ6RFH4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
GcsamQ6RFH4 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GcsamQ6RFH4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GcsamQ6RFH4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
GcsamQ6RFH4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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