Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp49Q6P9L4 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp49Q6P9L4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms