Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms