Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2bQ61313 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms