Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Vmn1r223Q5SSA0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Vmn1r223Q5SSA0 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Vmn1r223Q5SSA0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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