Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf608Q56A10 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms