Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Skap2Q3UND0 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms