Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctsll3Q3ULP7 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctsll3Q3ULP7 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctsll3Q3ULP7 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctsll3Q3ULP7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctsll3Q3ULP7 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctsll3Q3ULP7 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctsll3Q3ULP7 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctsll3Q3ULP7 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctsll3Q3ULP7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ctsll3Q3ULP7 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ctsll3Q3ULP7 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms