Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Q3U6N9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Q3U6N9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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