Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Rnf40Q3U319 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rnf40Q3U319 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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