Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Kdm4dQ3U2K5 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms