Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf6Q3TWW8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms