Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs3Q05895 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Thbs3Q05895 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms