Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Nf1Q04690 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms