Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ascl1Q02067 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ascl1Q02067 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms