Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Hoxd1Q01822 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxd1Q01822 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms