Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SeleQ00690 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms