Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itga4Q00651 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms