Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Acsl6-205ENSMUST00000094194 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Btg4-201ENSMUST00000114431 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm45837-201ENSMUST00000084894 4139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm42777-201ENSMUST00000196026 3603 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Cbx3-203ENSMUST00000114445 1585 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Atrip-205ENSMUST00000161521 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Sh3rf1-202ENSMUST00000209611 4416 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Ablim1-206ENSMUST00000111528 2481 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Nrxn3-203ENSMUST00000110133 2699 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Prdm16-204ENSMUST00000105636 8426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Snrpd3-201ENSMUST00000020397 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Agxt2-201ENSMUST00000022858 1825 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Atp5eP56382 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms