Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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SftpbP50405 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SftpbP50405 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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