Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rfx1P48377 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rfx1P48377 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rfx1P48377 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfx1P48377 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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