Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gli1P47806 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gli1P47806 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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