Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ItgavP43406 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms