Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
VhlP40338 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms