Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tgfb2P27090 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms