Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2-AaP01910 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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