Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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BckdkO55028 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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BckdkO55028 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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BckdkO55028 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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BckdkO55028 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BckdkO55028 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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