Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd2O35245 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms