Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

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Length 1,769 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm21631-201ENSMUST00000195041 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp6G5E8P0 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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