Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm25804-201ENSMUST00000122785 188 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Rce1-203ENSMUST00000224707 1255 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc1E9Q043 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms