Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccdc163A2AGD7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccdc163A2AGD7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms