Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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