Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cldn8Q9Z260 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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