Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Csnk1eQ9JMK2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms