Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Reep6Q9JM62 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Reep6Q9JM62 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Reep6Q9JM62 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Reep6Q9JM62 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Reep6Q9JM62 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Reep6Q9JM62 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Reep6Q9JM62 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Reep6Q9JM62 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Reep6Q9JM62 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Reep6Q9JM62 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Reep6Q9JM62 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms